GBA上的存档管理：
1. 在合卡菜单界面时，按下“START”键可进入SRAM管理界面（即存档管理界面）。本项仅提供查看和删除存档功能，用于解决以下情况：如果进入游戏时因存档备份区空间不足引起不能保存上一个游戏的存档，用户可以选择是否放弃前一个游戏的存档进入游戏或者取消返回合卡菜单，然后可以删除不需要的存档或用SMS功能备份后删除腾出需要的空间。
但是由于使用了存档压缩功能，可以同时支持1xx个ROM同时存档，并且存档的压缩备份和切换由GBA上的软件自动完成，因此通常情况下，用户无须进行该项操作。
2. 在合卡菜单界面时，按下“SELECT”键可进入SMS管理界面（即记忆棒管理界面）。首先有三个选项：“Backup Saver”（备份存档）、“Restore Saver”（恢复存档）、“Cancel”（取消）。GBA的上下键用来选择，A键是确定，B键是取消。
“Backup Saver”（备份存档）是将当前选中的游戏的存档备份到卡带的FLASH区。按A键进入备份菜单。菜单栏的最上面提示有当前选中的游戏的名称。GBA的左右键用来快速翻页，上下键用来备份位置，选择“NEW”是将存档备份到一个新位置上，执行完成后提示“done”表示备份存档完成。选择某个现有的存档，是将当前的存档覆盖原先该位置的存档数据。在覆盖前，会有提示框，提示是否覆盖，A键是确定，B键是取消，这样可以防止误操作。对于同一个游戏，进行多次备份时，会在游戏名后加序号来区分，第一次备份的序号为01，第二次为02。覆盖同一个游戏的旧存档时，会沿用原先的序号。
“Restore Saver”（恢复存档）是将FLASH区作为备份的存档恢复到SRAM区供当前选中的游戏使用。按A键进入恢复菜单。菜单栏的最上面提示有当前选中的游戏的名称。GBA的左右键用来快速翻页，上下键用来选择要恢复哪个存档，同一个游戏的多个存档用序号来区分，选中某个存档后，按A键进行恢复，执行完成后提示“done”表示存档完成。
删除存档 在“Backup Saver”（备份存档）界面或者“Restore Saver”（恢复存档）界面都可以执行删除操作，删除FLASH区的某个存档是用Select键来执行的。删除前会有提示，A键是确定，B键是取消，这样可以防止误操作。
PC上的存档管理：
1.存档数据的备份和更新
操作方法：首先连接好硬件，打开软件，进入等待连接模式。选择菜单中“卡带”一项下的“合卡游戏进度备份及更新”
在弹出的“合卡游戏进度备份及更新”窗口中，选中列表中的某个ROM，单击“备份存档”的按钮是将卡带中该ROM的存档备份到计算机中；单击“更新存档”的按钮是将计算机中的对应该ROM的存档文件更新到卡带中。
注：
“追加和删除ROM”和“备份和更新存档”功能必须使用与原来烧写卡带时的同一版本软件，否则可能不正常。
2.SMS数据的管理（即记忆棒数据的备份和更新）
在“卡带”菜单下，有三项功能。
“备份卡带的SMS数据”和“更新卡带的SMS数据”是对整个SMS数据进行备份和更新。
“卡带SMS数据管理”是单独对某个游戏存档的SMS数据进行备份，还可以在卡带的FLASH区添加新的SMS数据。如果添加或删除SMS数据，则要执行“写回卡带”命令，才能生效。
八、不插卡带玩游戏功能
这项功能可以在不插卡带的情况下，在GBA或者GBA SP上运行NES游戏或者符合multiboot格式的其它ROM。由于是在GBA或者GBA SP的内存中运行游戏，因此关机后游戏会丢失。
首先点击多页夹的“上传到GBA”，然后添加ROM，添加ROM的方法同烧写卡带的添加ROM方法。下图就是已经添加好的ROM列表。
需要注意的是由于GBA内存容量的限制，最大只能上传256K的数据，其中除去模拟器占用的空间(V9.8版的POCKETNES占用47K的空间）其它的空间才能用于上传游戏ROM，这样最大只能上传209K的ROM数据。在程序上显示有剩余的空间大小。不过有很多的NES游戏容量很小，即使209K的空间也足够容纳多个NES游戏。所以我们可以在列表中添加多个NES游戏传到GBA上来玩。
因为不用插卡带，所以无需任何按键，打开GBA电源就会进入等待连接状态。然后点击“传到GBA”就可以把游戏ROM传到GBA上了。在GBALi
