不使用4键软复位功能：个别游戏由于兼容性问题，当启用4键软复位功能时可能无法正常运行，这种情况可以选中本项取消软复位功能。
卡带密码：选中本项，会对整个卡带加上密码，在GBA上运行时，需要密码才能进入。在PC上设置密码时可以使用密码输入下拉框来选择已经设置好的密码，或者使用特定的按键来手动输入，"I K J L"是上下左右键，"Z X"是AB键，"A S"是LR键，其中方向键支持4个斜方向。这项功能对ZIP系列卡带和128M专用合卡均可使用。
使用存档备份功能：选中本项，会在卡带中建立一个SMS区域，可将存档数据压缩后写入其中，以保证存档数据永不丢失。
一般情况下，系统参数中的各项使用默认值即可。
六、烧写卡带
1.选择卡带类型
软件右上角有卡带选择框，在这里要正确选择你的卡带的类型。例如：如果你使用的是256M的ZIP_SE卡带，需要选择“ZIP_SE系列合卡256M”。需要注意的是，当要选择卡带类型时，要求多页夹“烧写卡带”中的ROM列表是空的。
2.添加游戏
首先是在“烧写卡带”项目下添加ROM。可以直接添加GBA的ROM文件、NES的ROM文件；也可以直接添加ZIP压缩文件。
由于ZIP系列卡带具有压缩功能。所以当使用ZIP系列卡带，在添加ROM时，如果ROM的大小符合条件，会弹出是否要压缩的提示。如果打算使用压缩功能。选择“专用格式”即可。如果不打算使用压缩功能，则可选择“不压缩”。
有的游戏加的有片头（比如一些汉化版的游戏），在添加时，会提示是否去掉片头，如果要使用软复位和金手指功能，则必须把片头去掉。但有个别游戏如果去掉片头会造成死机等情况，对于这种游戏不能去片头，不能使用软复位和金手指功能。
注：
普通FLASH卡带只能将ROM原封不动的写入到卡带中，这样128M的卡带就只能当128M的用，256M的就只能当256M的用。但采用了GBALink独创的压缩技术的ZIP系列卡带打破了这种局限。通过GBALink特有的压缩技术，可对ROM进行压缩，使其容量大大减小，这样在卡带中占用的空间就 非常小，同样容量的卡带就可以写入更多的ROM。例如：普通的256M的FLASH卡带只能写入4个64M的ROM，但64M的ROM经过专用技术压缩后大概只有32M，这样256M的ZIP卡带就可以写入8个这样的ROM，8个64M的ROM的实际容量大概是512M，也就是说256M的ZIP卡带可以容纳数据总量达到了512M。
3.烧写
连接好硬件，打开软件，进入等待连接模式。然后单击“智能烧写”按钮即可开始烧写卡带。
烧写完成后，即可在GBA上运行写入的ROM了。
注1：
当我们要对卡带进行“自动检测卡带类型”、“擦除卡带”、“烧写卡带”、“智能烧写”等功能时，需要让GBA进入一种特定的状态：等待连接模式。进入的方法是：首先同时按下游戏机的START键和SELECT键不松手，然后打开游戏机的电源开关，此时你会听到叮咚两声，GBA进入等待连接模式。在等待连接模式下，GBA的屏幕会一直保持“GAME BOY”字样，而不会运行卡带中的游戏。如果不这样的话，当GBA中插有卡带，而卡带中有内容时，开启GBA就会开始运行该内容，而不能执行其他操作了。
GBA的等待连接模式(点击图放大）
注2：
新卡带一般都是空的，内部没有数据。开机后直接就是等待连接模式，无需执行注1的操作。
注3：
“擦除卡带”的功能是将卡带擦空，“烧写卡带”是将游戏列表中的ROM烧写到空白卡带中，如果卡带有内容则不能使用该项，而要使用“智能烧写”。通常，用户无须考虑卡带是否有内容，添加ROM完毕后，直接执行“智能烧写”即可。
4.追加和删除ROM
对于ZIP系列卡带，即使烧写好游戏的卡带，仍可追加和删除游戏。操作方法如下：
将卡带插入GBA，进入等待连接模式。单击“刷新卡带”，会刷新出卡带内部的游戏列表。然后可以再添加新的游戏，或者删除一个或多个游戏后再添加新游戏，但删除游戏只能从最后一个开始删除。追加和删除完毕后，单击“智能烧写”即可。
“刷新卡带”这项功能不仅可以用于“追加和删除ROM”，还可用于修改已写入卡带内的ROM的属性：修改存档、软复位、金手指、ROM密码。
七、游戏存档的管理
存档管理包括两部分，一
